凝胶过滤是通过分子大小来分离不同的物质的，很多时候用于蛋白溶液的脱盐；对于成分分子量大小确定的蛋白溶液，可以通过比较分子量大小估计目的蛋白的洗脱时间，如果不确定各种蛋白的性质，只能接下每个蛋白峰然后鉴定，那应该怎么通过分子量大小的比较，来估计目的蛋白的洗脱时间？

    分子量大的，不能进入凝胶内孔，洗脱时间短，分子量小的，会进入凝胶内孔，洗脱时间长，但是这是相对的，比如两个大蛋白分子，都不能进入内孔，那么他们会同时洗脱出来，不能分离，所以凝胶适用于分子量差别较大的蛋白之间的分离。